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Data set(s): RLL + Work File
Period: 1 5 3 6 - 2 0 2 0
Record number: 4 1 0 0 5
  • Lücking, R./ Kalb, K. 2018: Formal instatement of Allographa (Graphidaceae): How to deal with a hyperdiverse genus complex with cryptic differentiation and paucity of molecular data [Formale Anerkennung von Allographa (Graphidaceae): wie man mit einem hyperdiversen Gattungskomplex mit kryptischer Differenzierung und wenigen molekularen Daten umgeht]. - Herzogia 31(1): 535-561. [RLL List # 257 / Rec.# 41005]
    Abstract: Previous molecular phylogenetic analysis showed that the genus Graphis sensu Staiger (Ascomycota: Ostropales: Graphidaceae) represents two separate, only distantly related lineages. Graphis s.str. comprises the species of the G. scripta and G. subserpentina groups (‘Eugraphis’), as well as part of the G. striatula group. For the segregate genus, the name Allographa is available, and this genus includes the G. acharii, G. dussii, G. marginata, G. nuda, and G. symplecta groups, plus part of the G. striatula group. Allographa is closer to the core Graphidaceae (Diorygma, Glyphis, Pallidogramme, Phaeographis, Platygramme, Platythecium, Sarcographa, Thalloloma, Thecaria), whereas Graphis s.str. is sister to this entire clade and takes a more isolated position on a very long branch. A previously published study of 313 taxa, using morphology-based phylogenetic binning, supported the placement of 103 species of Graphis s.lat. in Allographa. This analysis is here emended to include 453 taxa currently placed in Graphis and Hemithecium, with the result that based on molecular and binning data, 182 species are to be placed in Allographa and 271 to be retained or placed in Graphis. Two species, namely Allographa lutea and A. hypostictica, had already been described in that genus, leaving 180 additional combinations, 28 of which are being proposed in a parallel paper; the remaining new combinations (plus one replacement name) in Allographa and Graphis are proposed here. Two names are validated, namely Allographa anguilliradians Lücking ex Lücking species nova and Allographa uruguayensis Lücking ex Lücking species nova. Two new synonyms are established: Graphis ferrugineodisca Seavey & J.Seavey [= Glyphis atrofusca (Müll.Arg.) Lücking, synonymum novum], and G. mikuraensis Y.Ohmura & M.Nakan. [= Graphis srilankensis Weerakoon, Wijey. & Lumbsch, synonymum novum].
    – doi:10.13158/heia.31.1.2018.535

    Notes: New: A. adpressa (Vain.) Lücking & Kalb (≡ Graphis adpressa Vain.), A. albotecta (Redinger) Lücking & Kalb (≡ Graphina albotecta Redinger), A. altamirensis (Sipman & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis altamirensis Sipman & Lücking), A. amazonica (M.Cáceres, Aptroot & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis amazonica M.Cáceres, Aptroot & Lücking), A. angustata M.Cáceres, Aptroot & Lücking (≡ Graphis angustata Eschw.), A. anguilliradians Lücking (from Trinidad & Tobago), A. apertoinspersa (Rivas Plata & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis apertoinspersa Rivas Plata & Lücking), A. apoda (Zahlbr.) Lücking & Kalb (≡ Graphis illinata var. apoda Zahlbr.), A. aptrootiana (van den Broeck, Lücking & Ertz) Lücking & Kalb (≡ Graphis aptrootiana van den Broeck, Lücking & Ertz), A. argentata (Lücking & Umaña) Lücking & Kalb (≡ Graphis argentata Lücking & Umaña), A. asterizans (Nyl.) Lücking & Kalb (≡ Graphis asterizans Nyl.), A. balbisii (Fée) Lücking & Kalb (≡ Graphis balbisii Fée), A. balbisina (Nyl.) Lücking & Kalb (≡ Graphis balbisina Nyl.), A. barillasiae (van den Boom & Sipman) Lücking & Kalb (≡ Graphis barillasiae van den Boom & Sipman), A. bettinae (Lücking, Umaña, Chaves & Sipman) Lücking & Kalb (≡ Graphis bettinae Lücking, Umaña, Chaves & Sipman), A. bifera (Zahlbr.) Lücking & Kalb (≡ Graphis bifera Zahlbr.), A. brachylirellata (M.Cáceres & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis brachylirellata M.Cáceres & Lücking), A. bukittimaensis (Weerakoon & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis bukittimaensis Weerakoon & Lücking), A. calcea (Fée) Lücking & Kalb (≡ Opegrapha calcea Fée), A. carassensis (Vain.) Lücking & Kalb (≡ Graphis carassensis Vain.), A. celata (Stirt.) Lücking & Kalb (≡ Graphis celata Stirt.), A. cerradensis (Marcelli, Benatti & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis cerradensis Marcelli, Benatti & Lücking), A. chamelensis (A.B.Peña & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis chamelensis A.B.Peña & Lücking), A. chloroalba (Makhija & Adaw.) Lücking & Kalb (≡ Graphis chloroalba Makhija & Adaw.), A. chlorocarpa (Fée) Lücking & Kalb (≡ Graphis chlorocarpa Fée), A. chrysocarpa (Raddi) Lücking & Kalb (≡ O. chrysocarpa Raddi), A. cinerea (Fée) Lücking & Kalb (≡ Graphis cinerea Fée), A. cleistoblephara (Nyl.) Lücking & Kalb (≡ Graphis cleistoblephara Nyl.), A. cleistomma (Nyl.) Lücking & Kalb (≡ Graphis cleistomma Nyl.), A. cognata (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphis cognata Müll.Arg.), A. comma (Ach.) Lücking & Kalb (≡ O. comma Ach.), A. congesta (Fée) Lücking & Kalb (≡ O. congesta Fée), A. conglomerata (Spreng.) Lücking & Kalb (≡ Graphis conglomerata Spreng.), A. consanguinea (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphina consanguinea Müll.Arg.), A. contorta (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphina contorta Müll. Arg.), A. contortuplicata (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphis contortuplicata Müll.Arg.), A. curtiuscula (Zahlbr.) Lücking & Kalb (≡ Graphis curtiuscula Zahlbr.), A. cylindrospora (E.L.Lima, Lücking & M.Cáceres) Lücking & Kalb (≡ Graphis cylindrospora E.L.Lima, Lücking & M.Cáceres), A. daintreensis (A.W.Archer) Lücking & Kalb comb. inval., basionym not listed, A. dealbata (Nyl.) Lücking & Kalb (≡ Graphis dealbata Nyl.), A. dispersa (Redinger) Lücking & Kalb (≡ Graphina dispersa Redinger), A. dolichographa (Nyl.) Lücking & Kalb (≡ Graphis dolichographa Nyl.), A. dotalugalensis (Weerakoon, Wijey. & Rivas Plata) Lücking & Kalb (≡ Graphis dotalugalensis Weerakoon, Wijey. & Rivas Plata), A. elevativerrucosa (Chitale, Makhija & B.O.Sharma) Lücking & Kalb (≡ Graphis elevativerrucosa Chitale, Makhija & B.O.Sharma), A. elixii (A.W.Archer) Lücking & Kalb (≡ Phaeographina elixii A.W.Archer), A. elmeri (Vain.) Lücking & Kalb (≡ Graphis elmeri Vain.), A. epixantha (Mont. & Bosch) Lücking & Kalb (≡ Graphis epixantha Mont. & Bosch), A. exuta (S.Joshi, Upreti & Hur) Lücking & Kalb (≡ Graphis exuta S.Joshi, Upreti & Hur), A. farinulenta (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphis farinulenta Müll.Arg.), A. firferi (Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis firferi Lücking), A. flabillata (Makhija, Adaw. & Patw.) Lücking & Kalb (≡ Graphina flabillata Makhija, Adaw. & Patw.), A. flavens (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphis flavens Müll.Arg.), A. flavoaltamirensis (Sipman & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis flavoaltamirensis Sipman & Lücking), A. flavominiata (Moncada & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis flavominiata Moncada & Lücking), A. frumentaria (Fée) Lücking & Kalb (≡ Graphis frumentaria Fée), A. fujianensis (Z.F.Jia & J.C.Wei) Lücking & Kalb (≡ Graphis fujianensis Z.F.Jia & J.C.Wei), A. funilina (Aptroot) Lücking & Kalb (≡ Graphis funilina Aptroot), A. fournieri (Lizano & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis fournieri Lizano & Lücking), A. glauconigra (Vain.) Lücking & Kalb (≡ Graphis glauconigra Vain.), A. globosa (Fée) Lücking & Kalb (≡ O. globosa Fée), A. gomezii (Lücking, Will-Wolf & L.Umaña) Lücking & Kalb (≡ Graphis gomezii Lücking, Will-Wolf & L.Umaña), A. granulata (Fée) Lücking & Kalb (≡ Graphis granulata Fée), A. granulosa (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (Graphina granulosa Müll.Arg.), A. gregmuelleri (Sipman & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis gregmuelleri Sipman & Lücking), A. hadrospora (A.W.Archer) Lücking & Kalb (≡ Phaeographina hadrospora A.W.Archer), A. hainanense (Z.F.Jia) Lücking & Kalb (≡ Hemithecium hainanense Z.F.Jia), A. illinata (Eschw.) Lücking & Kalb (≡ Graphis illinata Eschw.), A. immersa (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphina immersa Müll.Arg.), A. incerta (Redinger) Lücking & Kalb (≡ Graphina incerta Redinger), A. ingarum (Vain.) Lücking & Kalb (≡ Graphis angustata var. ingarum Vain.), A. inspersostictica (Sipman & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis inspersostictica Sipman & Lücking), A. inturgescens (Kremp.) Lücking & Kalb (≡ Graphis inturgescens Kremp.), A. invisibilis (Dal-Forno & Eliasaro) Lücking & Kalb (≡ Graphis invisibilis Dal-Forno & Eliasaro), A. isidiata (Hale) Lücking & Kalb (≡ Thelotrema isidiatum Hale), A. itatiaiensis (Nelsen, Lücking & A.A.Spielm.) Lücking & Kalb (≡ Graphis itatiaiensis Nelsen, Lücking & A.A.Spielm.), A. knucklensis (Weerakoon, Wijey. & Wolseley) Lücking & Kalb (≡ Graphis knucklensis Weerakoon, Wijey. & Wolseley), A. laubertiana (Fée) Lücking & Kalb (≡ Graphis laubertiana Fée), A. lecanactiformis (Zahlbr.) Lücking & Kalb (≡ Graphina lecanactiformis Zahlbr.), A. leprographa (Nyl.) Lücking & Kalb (≡ Graphis leprographa Nyl.), A. leucaenae (Aptroot) Lücking & Kalb (≡ Graphis leucaenae Aptroot), A. longilirellata (B.O.Sharma & Khadilkar) Lücking & Kalb (≡ H. longilirellatum B.O.Sharma & Khadilkar), A. longissima (Makhija & Adaw.) Lücking & Kalb (≡ Graphis longissima Makhija & Adaw.), A. longula (Kremp.) Lücking & Kalb (≡ Graphis longula Kremp.), A. lourdesina (Aptroot) Lücking & Kalb (≡ Graphis lourdesina Aptroot), A. lumbschii (A.W.Archer) Lücking & Kalb (≡ Graphina lumbschii A.W.Archer), A. mahaeliyensis (Weerakoon, Jayalal & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis mahaeliyensis Weerakoon, Jayalal & Lücking), A. malacodes (Nyl.) Lücking & Kalb (≡ Graphis malacodes Nyl.), A. mexicana (Hale) Lücking & Kalb (≡ Thelotrema mexicanum Hale), A. miniata (Redinger) Lücking & Kalb (≡ Graphis miniata Redinger), A. mirabilis (Lücking, Sipman, Umaña & Chaves) Lücking & Kalb (≡ Graphis mirabilis Lücking, Sipman, Umaña & Chaves), A. multisulcata (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphina multisulcata Müll.Arg.), A. multistriata (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphina multistriata Müll.Arg.), A. myolensis (Aptroot) Lücking & Kalb (≡ Graphis myolensis Aptroot), A. nadurina (Aptroot) Lücking & Kalb (≡ Graphis nadurina Aptroot), A. nana (Fée) Lücking & Kalb (≡ O. nana Fée), A. norlabiata (Patw. & C.R.Kulk.) Lücking & Kalb (≡ Graphina norlabiata Patw. & C.R.Kulk.), A. nudaeformis (Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis nudaeformis Lücking), A. obtectostriata (Käffer & Aptroot) Lücking & Kalb (≡ Graphis obtectostriata Käffer & Aptroot), A. ochracea (C.W.Dodge) Lücking & Kalb (≡ Phaeographis ochracea C.W.Dodge), A. olivacea (Redinger) Lücking & Kalb (≡ Graphis olivacea Redinger), A. oryzaecarpa (Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis oryzaecarpa Lücking), A. oryzaeformis (Fée) Lücking & Kalb (≡ Graphis oryzaeformis Fée), A. ovata (Fée) Lücking & Kalb (≡ O. ovata Fée), A. oxyspora (Zahlbr.) Lücking & Kalb (≡ Graphina oxyspora Zahlbr.), A. pachygrapha (Nyl.) Lücking & Kalb (≡ Graphis pachygrapha Nyl.), A. parallela (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphis parallela Müll.Arg.), A. patwardhanii (C.R.Kulk.) Lücking & Kalb (≡ Graphis patwardhanii C.R.Kulk.), A. pedunculata (Bungartz & Aptroot) Lücking & Kalb (≡ Graphis pedunculata Bungartz & Aptroot), A. pilarensis (Cáceres & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis pilarensis Cáceres & Lücking), A. pitmanii (Rivas Plata & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis pitmanii Rivas Plata & Lücking), A. pittieri (Lücking, Umaña, Sipman & Chaves) Lücking & Kalb (≡ Graphis pittieri Lücking, Umaña, Sipman & Chaves), A. plagiocarpa (Fée) Lücking & Kalb (≡ Graphis plagiocarpa Fée), A. plumbea (Zahlbr.) Lücking & Kalb (≡ Graphina plumbea Zahlbr.), A. plurispora (Redinger) Lücking & Kalb (≡ Graphina pseudosophistica var. plurispora Redinger), A. polillensis (Vain.) Lücking & Kalb (≡ Graphis polillensis Vain.), A. polystriata (Makhija, A.Dube, Adaw. & Chitale) Lücking & Kalb (≡ Graphis polystriata Makhija, A.Dube, Adaw. & Chitale), A. pseudoaquilonia (Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis pseudoaquilonia Lücking), A. pseudocinerea (Lücking & Umaña) Lücking & Kalb (≡ Graphis pseudocinerea Lücking & Umaña), A. regularis (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphis regularis Müll.Arg.), A. ruiziana (Fée) Lücking & Kalb (≡ O. ruiziana Fée), A. salacinilabiata (Patw. & C.R.Kulk.) Lücking & Kalb (≡ Graphina salacinilabiata Patw. & C.R.Kulk.), A. salacinicum (G.Neuwirth, Aptroot & Stock.-Wörg.) Lücking & Kalb (≡ H. salacinicum G. Neuwirth, Aptroot & Stock.-Wörg.), A. sarawakensis (Hale ex Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis sarawakensis Hale ex Lücking), A. sayeri (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphis sayeri Müll.Arg.), A. scaphella (Ach.) Lücking & Kalb (≡ O. scaphella Ach.), A. singaporensis (Weerakoon & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis singaporensis Weerakoon & Lücking), A. sitiana (Vain.) Lücking & Kalb (≡ Graphis sitiana Vain.), A. sorsogona (Vain.) Lücking & Kalb (≡ Graphis sorsogona Vain.), A. sterlingiana (E.A.Tripp & Lendemer) Lücking & Kalb (≡ Graphis sterlingiana E.A.Tripp & Lendemer), A. subamylacea (Zahlbr.) Lücking & Kalb (≡ Graphis subamylacea Zahlbr.), A. subassimilis (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphis subassimilis Müll.Arg.), A. subcelata (A.W.Archer) Lücking & Kalb (≡ Graphis subcelata A.W.Archer), A. subelmeri (A.W.Archer) Lücking & Kalb (≡ Graphina subelmeri A.W.Archer), A. subflexibilis (Lücking & Chaves) Lücking & Kalb (≡ Graphis subflexibilis Lücking & Chaves), A. subimmersa (Fée) Lücking & Kalb (≡ O. subimmersa Fée), A. submirabilis (van den Boom & Sipman) Lücking & Kalb (≡ Graphis submirabilis van den Boom & Sipman), A. subradiata (Nyl.) Lücking & Kalb (≡ Graphis analoga var. subradiata Nyl.), A. subruiziana (Sipman, Chaves & Lücking) Lücking & Kalb (≡ Graphis subruiziana Sipman, Chaves & Lücking), A. subserpens (Staiger) Lücking & Kalb (≡ Graphis subserpens Staiger), A. subturgidula (Lücking & Sipman) Lücking & Kalb (≡ Graphis subturgidula Lücking & Sipman), A. superans (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphis superans Müll.Arg.), A. supertecta (Müll.Arg.) Lücking & Kalb (≡ Graphis supertecta Müll.Arg.), A. triphora (Nyl.) Lücking & Kalb (≡ Graphis triphora Nyl.), A. tamiamiensis (Lendemer) Lücking & Kalb (≡ Graphis tamiamiensis Lendemer), A. tumidula (Fée) Lücking & Kalb (≡ O. tumidula Fée), A. upduna Lücking & Kalb nom. nov. pro. H. isidiatum Upreti & U.Dubey), A. upretii (S.Joshi & Hur) Lücking & Kalb (≡ Graphis upretii S.Joshi & Hur), A. uruguayensis Lücking ex Lücking (from Urugugay), A. vandenboomiana (Ertz, Lücking & Van den Broeck) Lücking & Kalb (≡ Graphis vandenboomiana Ertz, Lücking & Van den Broeck), A. vernicosa (Fée) Lücking & Kalb (≡ O. vernicosa Fée), A. vestita (Fr.) Lücking & Kalb (≡ Graphis vestita Fr.), A. wangii (Z.F.Jia) Lücking & Kalb (≡ Graphis wangii Z.F.Jia), A. weii (Z.F.Jia & Kalb) Lücking & Kalb (≡ Graphis weii Z.F.Jia & Kalb), Graphis consociata (Makhija & Dube) Lücking & Kalb (≡ H. consociatum Makhija & Dube), Graphis crocea (Makhija & Adaw.) Lücking & Kalb (≡ H. croceum Makhija & Adaw.), Graphis fulvescens (Adaw. & Makhija) Lücking & Kalb (≡ H. fulvescens Adaw. & Makhija), Graphis microsperma (Chitale, Makhija & B.O.Sharma) Lücking & Kalb (≡ H. microspermum Chitale, Makhija & B.O.Sharma).
    URL: https://bioone.org/journals/Herzogia/volume-31/issue-p1/heia.31.1.2018.535/Formal-Instatement-of-Allographa-Graphidaceae--How-to-Deal-with/10.13158/heia.31.1.2018.535.full
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